Aufklärung der Genomstruktur des Raspberry Bushy Dwarf Virus (RBDV)

(1991 – 1991) Zentralinstitut für Genetik und Kulturpflanzenforschung, Gatersleben; Scottish Crop Research Institute, Dundee, DD2 5DA, U.K.

Thema

Das Raspberry Bushy Dwarf Virus (RBDV) ist ein weltweit verbreitetes Pathogen, das Himbeeren und Brombeeren befällt. Von anderen Pflanzenviren unterscheidet es sich in einigen Eigenschaften. So kann es über den Pollen infizierter Pflanzen übertragen werden. Die genetische Information des Virus ist in drei RNA-Strängen gespeichert.

Ziel des Projektes war die Aufklärung der Genomstruktur auch als Voraussetzung für weiterführende gentechnische Arbeiten.

Zusammenfassung

Vergleiche mit Nichtstrukturproteinen des Alfalfa Mosaic Virus (AMS), Brome Mosaic Virus (BMS), Cucumber Mosaic Virus (CMS) und des Tabacco Mosaic Virus ließen Übereinstimmungen erkennen, die eine Zuordnung des Raspberry Bushy Dwarf Virus zu Sindbis-ähnlichen Viren erlauben.

Gleichzeitig unterscheidet sich jedoch das Raspberry Bushy Dwarf Virus von den oben genannten Viren. Das Protein der RNA-1 des Raspberry Bushy Dwarf Virus vereinigt zwei Enzymfunktionen (Helikase und Polymerase) zur Virusvermehrung. Im Falle des AMV, BMV und CMV werden diese Funktionen dagegen von zwei RNA-Spezies kodiert.

Das RBDV ist somit Vertreter einer neuen Virusgruppe, für die die Bezeichnung „Idaeoviren“ vorgeschlagen wird.

Das Projekt wurde nicht fortgeführt.

Versuchsbeschreibung

Aufklärung des Virus-Genoms

Virus-Partikel wurden aus infizierten Pflanzen isoliert, die drei unterschiedlichen RNA-Spezies des Virus getrennt und die Basenabfolge der RNA-1 analysiert.

Systematische Einordnung des Virus

Durch Sequenzvergleiche der RNA1 des Raspberry Bushy Dwarf Virus mit der RNA anderer Viren können Aussagen über verwandtschaftliche Beziehungen des Virus getroffen werden.

Ergebnisse

Die Gesamtlänge der sequenzierten RNA1 des Raspberry Bushy Dwarf Virus beträgt 5449 Nukleotide. Ein Sequenzvergleich mit der RNA anderer Viren ergab Übereinstimmungen mit Sindbis-ähnlichen Viren. Aus diesen Vergleichen lässt sich schließen, dass das Proteinprodukt der RNA1 eine Rolle bei der Verdopplung der Erbinformation spielt. Das Protein vereinigt zwei Enzymfunktionen (Helikase und Polymerase).