Transkriptionsfaktoren sind Proteine, die für die Initiation der RNA-Polymerase bei der Transkription von Bedeutung ist.

Sie binden entweder direkt an die DNA (etwa an die TATA-Box) oder an die RNA-Polymerase. Dabei unterscheidet man zwischen allgemeinen und speziellen Transkriptionsfaktoren. Allgemeine Transkriptionsfaktoren binden direkt an die DNA und bilden somit eine geeignete Andockstelle für die RNA-Polymerase. 

Spezifische Transkriptionsfaktoren binden nur an spezielle Gene, nämlich an die, welche transkribiert werden sollen. Damit wird der RNA-Polymerase deutlich gemacht, welches Gen an der Reihe ist. Sie binden im Bereich der Enhancer oder Silencer an die DNA, je nachdem, ob das Gen aktiviert oder reprimiert werden soll.

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