In dem Verbund aus Forschungs- und Wirtschaftsunternehmen sollen neuartige Methoden zur Anreicherung und Identifikation von SNPs in Genen getestet und optimiert werden, damit gezielt molekulare Marker für die Züchtung in polyploiden Kulturpflanzen generiert und die genetische Variabilität in spezifischen chromosomalen Regionen untersucht werden kann.

Dazu werden die Techniken ‚Sequence capture’ und ‚Next Generation Sequencing’ eingesetzt, um SNPs (single nucleotide polymorphism) im hexaploiden Weizen zu identifizieren. Detailliert werden mehrere genomische Regionen, welche interessante QTLs für züchterisch wichtige Eigenschaften enthalten, gezielt mit Markern gesättigt. Ferner werden spezifisch Marker generiert, welche in Interaktionen mit dem Projekt ‚Tritex’, das die physikalische Kartierung von Chromosom 6A in Weizen zum Thema hat, dazu verwendet werden, eine gesättigte genetische Karte für die Chromosomen der Gruppe 6 zu generieren.

Eine erfolgreiche Projektdurchführung wird es erlauben, Erfahrungen in der gezielten Markerentwicklung für spezifische genomische Regionen von polyploiden Pflanzen mit einem sehr großen Genom zu gewinnen.