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PLANT BIOTECHNOLOGY


Auswahl und Identifikation molekularer Marker in spezifischen genomischen Regionen mit züchterisch wichtigen Eigenschaften und für die allgemeine genetische Kartierung in hexaploidem Weizen für eine beschleunigte Pflanzenzüchtung

Koordinator: Herr Dr. Martin Ganal – (TraitGenetics GmbH)

Projektbeschreibung

In dem Verbund aus Forschungs- und Wirtschaftsunternehmen sollen neuartige Methoden zur Anreicherung und Identifikation von SNPs in Genen getestet und optimiert werden, damit gezielt molekulare Marker für die Züchtung in polyploiden Kulturpflanzen generiert und die genetische Variabilität in spezifischen chromosomalen Regionen untersucht werden kann.

Dazu werden die Techniken ‚Sequence capture’ und ‚Next Generation Sequencing’ eingesetzt, um SNPs (single nucleotide polymorphism) im hexaploiden Weizen zu identifizieren. Detailliert werden mehrere genomische Regionen, welche interessante QTLs für züchterisch wichtige Eigenschaften enthalten, gezielt mit Markern gesättigt. Ferner werden spezifisch Marker generiert, welche in Interaktionen mit dem Projekt ‚Tritex’, das die physikalische Kartierung von Chromosom 6A in Weizen zum Thema hat, dazu verwendet werden, eine gesättigte genetische Karte für die Chromosomen der Gruppe 6 zu generieren.

Eine erfolgreiche Projektdurchführung wird es erlauben, Erfahrungen in der gezielten Markerentwicklung für spezifische genomische Regionen von polyploiden Pflanzen mit einem sehr großen Genom zu gewinnen. 


Selection and identification of molecular markers in specific genomic regions with importance to breeding and for general mapping in hexaploid wheat for an acceleration of plant breeding

Coordinator: Herr Dr. Martin Ganal – (Institut)

Project description

In a consortium of academia and industry, novel methods for enrichment and identification of SNPs in genes will be tested and optimized for development of molecular markers for breeding of polyploid crop plants and for studying the genetic variability of specific chromosomal regions.

For this purpose, sequence capture technology and novel sequencing techniques will be used for the identification of SNPs (single nucleotide polymorphism) in hexaploid wheat. In detail, several genomic regions with interesting QTLs for important traits will be saturated with molecular markers. Additionally, markers will be generated for chromosome 6A of wheat, for which a physical map is constructed in the project ‘Tritex’.

A successful project will provide experiences in the specific development of markers for special genomic regions of polyploid plants with a large genome.

Teilprojekte

0315949A
Fördersumme: 489.264,00 €

Laufzeit 01.11.2011 – 31.12.2015


Herr Dr. Martin Ganal

TraitGenetics GmbH


E-Mail-Kontakt

Tel: +49 39482 7997-0

Am Schwabeplan 1b

06466 Stadt Seeland OT Gatersleben

Deutschland


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0315949B
Fördersumme: 383.727,00 €

Laufzeit 01.11.2011 – 31.12.2015


Frau Dr. Marion Röder

Leibniz


Institut f. Pflanzengenetik u Kulturpflanzenforschung

Corrensstrasse 3

06466 Seeland OT Gatersleben

Deutschland


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