GABI FUTURE

DUPLO

Eine Sammlung von Doppelmutanten duplizierter Gene bei Arabidopsis thaliana

Koordinator: Prof. Dr. Dario Leister – Ludwig-Maximilians Universität München

Projektbeschreibung

Eine signifikante Anzahl der im Kern kodierten Gene von Arabidopsis thaliana liegen in Bereichen der Chromosomen, die durch segmentale Genomduplikationen verdoppelt wurden. Diese genetische Redundanz manifestiert sich in mehr als 2000 Paaren paraloger Gene, welche häufig überlappende oder redundante Funktionen haben. Dies bedeutet, dass ihre funktionelle Charakterisierung die Inaktivierung beider Gene erfordert. Um dies zu ermöglichen, werden wir eine Sammlung von Doppelmutanten dieser duplizierten Gene von A. thaliana aufbauen. Als Ausgangspunkt dienen SALK und GABI-Kat Insertionsmutanten im Ökotyp Columbia-0. Zunächst wird eine genaue Analyse des A. thaliana Genoms durchgeführt, um Genpaare mit hoher Ähnlichkeit bezüglich Sequenz und Expressionsmuster, genügend Distanz zu einem möglichen dritten homologen Gen und mit verfügbaren Insertionsmutanten für beide beteiligten Gene zu finden. Die jeweiligen Insertionsallele werden identifiziert und überprüft, und es werden für das jeweilige Insertionsallel homozygote Nachkommen ausgewählt. Zwei zu einem paralogen Paar gehörige Linien werden miteinander gekreuzt, um Mutanten zu erzeugen, die heterozygot für beide Mutationen sind. Über PCR-gestütztes Genotypisieren und Vermehren werden in der nächsten Generation homozygote Doppelmutanten generiert und bestätigt. Anormalitäten in der Morphologie und Entwicklung der Doppelmutanten werden während der Anzucht dokumentiert. Die im Projekt erstellten Doppelmutanten werden durch Abgabe an das NASC (“Nottingham Arabidopsis Stock Centre”) für die wissenschaftliche Gemeinschaft verfügbar gemacht.

Partner
Universität Bielefeld
Lehrstuhl fuer Genomforschung
Deutschland
Prof. Dr. Bernd Weisshaar
Dept. of Biology
Tel: +49-521-106-8721
33594 Bielefeld
E-Mail-Kontakt
Ludwig-Maximilians Universität München, München
Department für Biologie I
Deutschland
Prof. Dr. Dario Leister
Koordinator
Großhadernerstraße 4
82152 Planegg-Martinsried
Ludwig-Maximilians Universität München, München
Department für Biologie I
Deutschland
PD Dr. Cordelia Bolle
Koordinatorin
Großhadernerstraße 4
82152 Planegg-Martinsried
Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
Institut für Bioinformatik und Systembiologie (IBIS)
Deutschland
Dr. Klaus Mayer
Ingolstädter Landstr. 1
5764 Neuherberg
E-Mail-Kontakt
Eckdaten
G

GABI FUTURE

DUPLO

Projektlaufzeit

01.01.2008 - 31.12.2010

Fördersumme

Öffentlich: 1.478.889,00 €
Privat: 0,00 €
Gesamt: 1.478.889,00 €