GABI FUTURE

BARLEX

Physische Karte des Gerstengenoms

Koordinator: Dr. Nils Stein – Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)

Projektbeschreibung

Ziel des Projektes ist die Ergänzung / Vervollständigung einer physischen Karte des Gerstengenoms und deren Verankerung an die genetische Karte. Zur Unterstützung eines laufenden internationalen Kooperationsprojektes (Leibniz Pakt für Forschung & Innovation, IPK/ACPFG Adelaide/TU München) wird mittels der anerkannten Technik des High Information Content Fingerprinting (HICF) eine BAC Bibliothek (ca. 5-fache Repräsentation des haploiden Gerstengenoms) analysiert und in die im Aufbau befindliche physische Karte des Gerstengenoms integriert. Um eine effizient Nutzung der entstehenden Ressource zu erzielen, bedarf es der genetischen Verankerung der Contig Karte. Dies wird durch Screenings der verwendeten BAC Bibliotheken mit gen-basierten Markern und durch die Hochdurchsatz 454 Sequenzierung von 3000 BAC Klonen erzielt. Auf diese Weise werden innerhalb dieses Projektes Sequenzdaten für ca. 6% des Gerstengenoms erhoben.

Diese entstehende öffentliche Resource wird die effiziente Isolierung eines (prinzipiell) jeden Gens aus Gerste, und zu grossem Teil aus verwandten Arten wie Weizen und Roggen, erleichtern. Sie wird wesentliche, neue Einblicke in Struktur und Organisation des Gerstengenoms liefern und ausserdem als Grundlage für eine weitgehende Sequenzierung des Gerstegenoms dienen.

Eckdaten
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GABI FUTURE

BARLEX

Projektlaufzeit

01.07.2007 - 31.12.2010

Fördersumme

Öffentlich: 6.778.550,00 €
Privat: 0,00 €
Gesamt: 6.778.550,00 €
Herr Dr. Klaus F. X. Mayer
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Helmholtz Zentrum München - German Research Center for Environmental Health (GmbH)

Ingolstädter Landstraße 1
85764 Neuherberg
Deutschland
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Herr Prof. Dr. Frank Ordon
E-Mail-Kontakt
Julius Kühn-Institut (JKI)
Bundesforschungsinstitut für Kulturpflanzen

Erwin-Baur-Str. 27
06484 Quedlinburg
Deutschland
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Herr Dr. Matthias Platzer
E-Mail-Kontakt
Leibniz-Institut für Altersforschung
Fritz-Lipmann-Institut e. V. (FLI)

Beutenbergstr. 11
07745 Jena
Deutschland
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Herr Dr. Nils Stein
E-Mail-Kontakt
Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)

Corrensstrasse 3
06466 Gatersleben
Deutschland
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