Einer Genkarte ist die lineare Anordnung der Gene im Genom eines Organismus zu entnehmen. Man unterscheidet genetische und physikalische Genkarten. Genetische Karten geben die Reihenfolge von Genorten an. Auf einer physikalischen Genkarte sind die genauen Abstände zwischen Genen gemessen in Basenpaaren eingetragen.

Obwohl die Anordnung der Gene auf beiden Kartenarten die gleiche ist, gibt es keine universal gültige „Umrechnungsformel“ zwischen den beiden Kartenarten. Der Grund dafür ist, dass Rekombinationshäufigkeiten je nach Region des Genoms extrem stark variieren.

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