Der Begriff Haplotyp ist eine Abkürzung, die für „haploider Genotyp“ steht.

Haplotypen sind Blöcke von Genvarianten (Allelen), die eng miteinander gekoppelt sind und in einem Chromosomenabschnitt im Erbgut liegen. Sie werden gemeinsam vererbt und nicht durch Rekombinationsereignisse getrennt. Diese Kopplung lässt vermuten, dass sie gemeinsam wirken und für die Ausprägung eines Merkmals verantwortlich sind.

Ein Haplotyp kann spezifisch sein für einzelne Individuen, Populationen oder gar die ganze Art.

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