Als Phyllosphäre bezeichnet man den Lebensraum auf der Oberfläche von Blättern und Blattscheiden, der vor allem von Mikroorganismen besiedelt wird.

Zu den Mikroorganismen, die auf Blattoberflächen leben, gehören (Proteo-) Bakterien und Hefen. Aber auch Pflanzenviren, Archaeen, Myxomyceten, Grünalgen und tierische Einzeller können sich auf Blättern ansiedeln. Mikroorganismen gelangen hauptsächlich über Wind, Regenspritzwasser, Tauabfluss und durch Insekten auf Pflanzen. Dort ernähren sie sich von den ausgeschiedenen Stoffwechselprodukten ihrer Wirtspflanze.

In der Pflanzenforschung wurde in den letzten Jahren vor allem die Zusammensetzung mikrobieller Gemeinschaften in der Phyllosphäre untersucht. Ursprünglich lag das Hauptinteresse auf der Untersuchung von Krankheitserregern. Mittlerweile spielt auch die Bedeutung der für Pflanzen neutral oder gar positiv wirkenden Mikroorganismen eine wichtige Rolle. Die Erkenntnisse werden beispielsweise für den biologischen Pflanzenschutz genutzt.

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