Ein Pangenom (oder Supragenom) bezeichnet die Gesamtheit aller Gene für alle Stämme innerhalb einer Klade.

Das Pangenom umfasst zwei Untergruppen:

  • Kerngenom: Die Gene des Kerngenoms besitzen alle Stämme. Es handelt sich beispielsweise um Haushaltsgene für den Grundstoffwechsel.
  • Akzessorisches oder variables Genom: Diese „entbehrlichen“ Gene kommen nur in einer Untergruppe der Stämme vor. Sie ermöglichen beispielsweise den Organismen spezifische Anpassungen an ihre individuellen Umweltbedingungen.

Die Untersuchung des Pangenoms wird als Pangenomik bezeichnet. Pangenome wurden ursprünglich für Bakterien- und Archaea-Arten konstruiert, aber in jüngerer Zeit wurden auch eukaryotische Pangenome entwickelt, insbesondere für Pflanzenarten.

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